Quantum chemistry calculation with python.

In this weekend, I played molecular design toolkit. https://bionano.autodesk.com/MolecularDesignToolkit/ This is very nice open source tool kit for pythonist I think. At first, I tried to install the TK in OSx directly, but I had some trouble to run the code. So I installed my linux virtual PC. It is not so difficult to installContinue reading “Quantum chemistry calculation with python.”

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家族で旅行に行った話

どちらかというと自分が出不精な性格であまり遠出しないタイプなのですが、この連休は家族や、子供の友達の家族と小田原の方に遊びに行きました。 昨日は小田原のわんぱくランドhttp://www.city.odawara.kanagawa.jp/public-i/park/wanpaku/というところに行ってきました。 駐車料金だけで入場料とかはかからないし、色々遊具があるので、アクティブに遊びたい家族にはいい場所かもと思います。 ただ、昨日は天気良すぎて暑いこと暑いこと、、、一緒になって遊んでるとこっちがやられてしまいそうになってきた。 暑い中ずーっと走り回って遊んで、ホテル行ってからもずっとハイテンションで花火して一瞬で寝てしまったようだ。 今日は今日で朝からプール行って公園行ってずーっと遊び通し。子供が成長して体力がついてくるのと逆にこっちはどんどん体力がなくなってくるのでしんどいしんどい。 負けないように走り込みと筋トレしないと。。。。

Mishima.syk #10に参加した話

 今回で記念すべき10回目となるmishisima.sykに参加してきました。  私は、機械学習+luigiを使ったパイプラインの話をしました。何かしら参考になる情報が提供できていればいいのですが。 今回は機械学習ネタ、バイオ系のネタ、パイプライン系のネタ、国内創薬業界のアイドルの話、さらにはAI(愛?)の話、美味しいお好み焼きの話など多岐にわたる話題がありました。 発表者の皆様、参加者の皆様、感じの皆様本当にありがとうございました。とても楽しい時間を過ごすことができました。  今回もいつもながら発表者のプレゼンのクオリティが高くビビりました。面白くかつ本質をビシッと表現できるってのはやっぱり問題の本質をしっかり見据えてかつ、それを理解してないとできないことだと思います。  私は普段シーケンスとかNGSみたいな仕事に関わることないので、MinIONなど初めて知りました。 あのサイズで、、、技術、科学の進歩ってすごいですね、、、  有機合成でもFlow ChemistryやLab on chipなどありますし、集積化高速化は研究のキーになるところですかね。 勉強会中も懇親会でも色々と良いお話を聞くことができました。 まだまだ勉強全然たらん。明日から頑張ろうと思います。 また次回も開催したいですね。

Platfrom-as-a-Service for Deep Learning.

Yesterday, I enjoyed mishima.syk #10. I uploaded my presentation and code to mishimasyk repo. I introduced briefly about a PaaS for DL named ‘Floyd’. I think the service is interesting because I can run DL on cloud with GPU! So, I describe very simple example to start DL with “FLOYD” ;-) At first, Make accountContinue reading “Platfrom-as-a-Service for Deep Learning.”

ドッジボール

子供の頃ドッジボールよくやりました。最近長男がはまっている。公式ルールがあるなんて知らなかった。 https://www.dodgeball.or.jp/%E3%83%89%E3%83%83%E3%82%B8%E3%83%9C%E3%83%BC%E3%83%AB%E3%81%A8%E3%81%AF/ そして長男くんは最近地区のドッチボールチームに入りました。本格的にやってるチームはアタッカーとか、カッターとか役割もあり当てればいいって雰囲気ではなくしっかりと戦略があるので面白いし、迫力がある。練習しっかりやって成長したら負けそう。 さて、 今日は地域の小学校で予選を勝ち抜いてきたチームの大会でした。 体育館はむちゃくちゃ暑かったが、みんな元気に最後までやってました。朝8時から16時くらいまで、、さらにそのあと公園で遊びだし、、、。 体力すでに負けてそうだ。いや、負けてる、、、 まあ、好きなこと見つけて熱中してくれるといいなと思う。 しかし子供はHPが0になるまで全力で遊ぶなぁ。