mishima.syk#6 etc.

Today I presented at mishima.syk#6 about rdkitjs.
I wrote very simple script using rdkitjs and d3js.
This script can make scatter plot about fraction of Csp3 and molwt and when user mouse over the circle, rdkitjs return molecule image.
Like this.
Screen Shot 2015-07-25 at 9.29.50 PM
I uploaded the script to github.
https://github.com/iwatobipen/mishimasyk/tree/master/mishimasyk6
I hope, participants enjoyed my presentation….

The presentation about FMO was very impressive for me. The method will provide to medchem about more details of ligand-target interaction.
Presentation about real Docking and data management and ingress were also very interesting!

And I enjoyed a workshop it was held yesterday.
It was worth for me about how do you think about SAR from given dataset.
It seems to be dependent on philosophy of chemist. 😉
Thank for all participants and presenters.

昨日は某WS,本日はmishimasykと個人的面白イベント2連続でした。
WSではいろんな企業のケミストとの方とお話できたり、一つのデータを見て解析してみたりと貴重な時間を過ごせたかなと思っております。またこういった企画あるといいですね。
今日私はrdkitjsの話をしました。
1週間くらいウンウン唸ってなんとかサンプルスクリプトを作ったんですが、興味を持っていただけたようで何よりです。
d3jsはデータをjsonで渡せて色々とアノテーションがつけられるのでいいですよね。もうちょっと使いこなしたい。
FMOのdeepな話はとても刺激になりました。分子設計におけるファーマコフォアの考え方、ロジックの立て方がちょっと変わるような発見があって勉強になりました。
tool kitのハンズオン、リアルドッキングの話、データマネジメントの話、プレゼンは毎回楽しく勉強になります。
みなさんどうもありがとうございました。
スライドはスライドシェアにコードはgithubにあげました。
少しでも参考になっていたら嬉しいっす。次は深層学習かしら。

https://github.com/iwatobipen/mishimasyk/tree/master/mishimasyk6

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