Rethinking about the role of medicinal chemist.

I have been working as medicinal chemist for over 10 years. Now I’m reading old reviews the title ‘THE ROLE OF THE MEDICINAL CHEMIST IN DRUG DISCOVERY —THEN AND NOW‘ Nature Reviews Drug Discovery 3, 853-862 (October 2004) | doi:10.1038/nrd1523. I always ask to myself “why I wanted to be medicinal chemist ?” and “what

2014年のまとめ

サマリーが送られてきました。 自動なんでしょうけど、ぼちぼちですが書いていると後で見返すのもいいものですね。 年内にもう一記事くらい書けるかな。 WordPress.com 統計チームは、2014年のあなたのブログの年間まとめレポートを用意しました。 概要はこちらです。 ニューヨーク市の地下鉄には1,200人が乗車できます。2014にこのブログは約5,900回表示されました。ニューヨークの地下鉄に置き換えると、約5台分になります。 レポートをすべて見るにはクリックしてください。

冬休み

金曜日で仕事納めにしたので今日は家族で富士山こどもの国に来ています 雪遊びするとずっと言ってたのに着いたらやりたがらず(；´Д｀) 最後でやっとエンジンかかって1人で遊んでくれた いや〜わかんないですねぇ

simple test

Recently I moved my main PC from MBA mid 2011 to MBP mid 2014. This machine has GPU. There are some libraries to use GPU from python. i.e. PyCuda, PyOpenGL, Theano, etc… I used theano and write very simple test. Compare the time for calculate dot product of two arrays of numpy and theano. 1st

Deep learning from web-browser

Deep-learning is one of hot topics in myself. There are some libraries in python e.g. Theano, Pylearn2, Nolearn. Today I used h2o. It is easy to install in machine. Just download h2o from oxidata’site. http://0xdata.com/#/ Then extract zip file and run it. and… Now local server will start. Access localhost:54321. From web blowser it is

A Task-Based Parallelization Framework

Jug is a python library for parallelization. The library easy to install by using pip. Today I wrote some example to use it. First get sample data from ZINC DB. Got 4M mols. Too much for test. So, I used 10,000 mols Next, made sample script named jug_rdk.py After jug installed, I could use jug