After mishima.syk #4

Thank a lot for all attendance and presenters at mishima.syk #4 !
I enjoyed the event and party.
All presentations were very interesting and exciting. 😉
I made brief introduction about cytoscape.js, and up loaded my slide and sample code to slide share and git hub.
slide link
code link
My sample apps will need Flask, and Flask-Bootstrap. They can be installed using pip.
My mistake was that I forgot mention about my test environment.
Sample code does not work on Chrome…..
I couldn’t fix the bug. Firefox, and Safari may be work well.
But in chrome, run the app from terminal and access 127.0.0.1:5000 .
Then open javascript console in your browser and type following code , you can draw network.

cy.load(items)

Hmm, I want to study more and more.

今回のmishimasyl勉強会は次世代シーケンサの話に始まり、ネットワーク関連の話題でサンプルをいじりながらあれこれとやったり、事例紹介をしていただいたりと、勉強になりました。
 NGsの解析は最終的な解析に至るまでのステップがかなり大変そうな印象を持ちました。
データの解析というとだいたい最後のステップの可視化から何かをひもとく部分をイメージすることが多い気もしますがデータの準備超大事ですよね、その辺のプロセスが垣間見えたのはよかったです。
 ネットワーク関連の話もたのしく聞かせていただきました。igraph便利ですね。
画像を解析するっての思想がなかったんでおおって感じです。
 早速本はポチった。
今回もありがとうございました。

*ちなみにサンプルサイトのCOLAだけがmapDataを使っていて
*トップのページだけがノードをクリックすると画像をとるサイトに飛ぶようになっていて
*後のページはすべてアラートでsmilesが出ます
html部分は後から書き足ししたこともあり、ライブラリ全部毎回読んでいたりと冗長に思われるかもしれません。

Advertisements

Leave a Reply

Fill in your details below or click an icon to log in:

WordPress.com Logo

You are commenting using your WordPress.com account. Log Out / Change )

Twitter picture

You are commenting using your Twitter account. Log Out / Change )

Facebook photo

You are commenting using your Facebook account. Log Out / Change )

Google+ photo

You are commenting using your Google+ account. Log Out / Change )

Connecting to %s