RDKitでsim matrix

RDKitは自分のお気に入りのツールです。 Pybelも優れているのだが最初に触ったのがRDKitということでよく使っています。 SDFから分子を読んで類似性でマップを作る場合 みたいな感じでしょうか。 テキストにタニモト係数0.7以上の化合物ペアが出るのでcytoscapeで見ると ネットワークが見えるかと思います。結構このビジュアル方法私は好きです。

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